.cram Extensie de fișier
Tip fișierCompressed Alignment File
| Dezvoltator | EBI |
| Categorie | Fișiere de date |
| Format | Binary |
.CRAM numărul opțiunii
Formatul fișierului de aliniere comprimat dezvoltat de EBI, un punct de referință al Laboratorului European de Biologie Moleculară; stochează aliniamentele citirii secvențelor scurte de ADN generate de alinierele de citire scurte, cum ar fi BWA, BBMap și BLAT.
Formatul de fișiere CRAM este similar formatului de fișier aliniament binar / hărți (BAM), dar are o compresie mai bună a fișierelor și un format de container binar orientat pe coloane. Pe măsură ce volumele de date cresc în domeniul software-ului genetic, formatul CRAM a fost conceput pentru a reduce amprenta piciorului de disc al datelor de aliniere.
Alinierea cu citiri scurte este procesul de descifrare a locului în care provine o secvență din genom. Acest lucru poate fi dificil deoarece genomul de referință este destul de mare și nu căutați întotdeauna potriviri exacte în genomul de referință. Cititoarele de citire scurte sunt folosite pentru a căuta secvențe enorme pentru potriviri și potriviri apropiate. Deoarece secvențele sunt atât de mari, comprimarea oferită de formate precum CRAM este necesară pentru a menține dimensiunile fișierelor ușor de gestionat.
| Windows |
|